系統污染：這種情況下，將儀器接雙通，采用10%異丙醇，低流速過夜沖洗儀器。

進樣口污染：進樣口用水-乙腈-異丙醇-乙腈-水的順序充分清洗。

色譜柱殘留：色譜柱在進過高濃度樣品后再進低濃度樣品色譜柱上會有殘留，這種情況可以先多進幾針空白溶劑，或將色譜柱用過渡流動相過渡后，用高比例有機相低流速過夜沖洗后，再進行檢測或更換新的沒有污染的色譜柱。

配樣試劑干擾，配樣試劑純度不純，或放置后，會產生雜質。如是溶劑放置時間過久產生干擾，重新配制即可。如是試劑純度引起的干擾，可以更換更高純度級別的試劑進行試驗。

流動相試劑純度不夠，這種情況容易在低波長下出干擾峰，這種情況下，可以更換更高純度級別的試劑，或加雜質捕集柱來去除干擾。

一體式蓋墊，因蓋墊為用特殊膠粘合的，特殊條件下，會溶于溶劑出峰，這種情況下，選用分體式蓋墊，即可。

液相樣品進樣前，需用過濾膜過濾，有些過濾膜會產生雜質出干擾峰，這種情況下，需更換不同的過濾膜來解決。

如采取以上方法后，干擾還是無法去除，則需考慮更換溶劑。